―――桜舞う季節。少年の、記憶を辿る旅が始まる。

都会の厳しさに揉まれ、心を痛めた生駒一月（いこまいつき）は、昔住んでいた町にあてもなく戻ってきた。
記憶の中の景色と、何一つ変わらない町。そこで彼は、死んだはずの少女、霧島千春（きりしまちはる）を見る。
千春は突如一月に刀を突きたてるが、殺す直前になって逃げるように去っていく。
思う。
「俺は、遠い昔の思い出に戻ってきてしまったのだろうか――――」

住む場所のない一月は、幸いにも居候させてくれるという人を見つける。住まうことになったのは大層な屋敷で、住んでいるのは家主と少女だった。
一月は居候の代わりにバイトを命じられる。それはこの町に現れる「妖（あやかし）」に関する事件を解決していくものだった。家主は「陰陽師」だったのだ。
また、一月は家主の計らいで町の高校に編入させてもらえることになった。高校２年の編入生として、新たな学園生活が始まる。